El gobierno Brasileño planea unir el Ministerio de Medio Ambiente con el Ministerio de Agricultura. Por ello, especialistas afirman que esta unión es riesgosa para el entorno ambiental, ya que amenazaría la Amazonía,de manera que el porcentaje de devastación de bosques puede llegar a ser de solo el 20% en algunas partes del país, pero en el Amazonas es del 80%. Los gobiernos deben insertar mejores pólizas medio ambientales, especialmente, para la conservación del Amazonas.

Desde inicios del 2000 hasta la fecha, se han perdido 1 974 209 hectáreas de bosques en la Amazonia peruana. En síntesis, la agricultura, la ganadería, el narcotráfico, la tala y minería ilegal son los principales causantes de la deforestación amazónica, señala el Ministerio del Ambiente. En la región de Madre de Dios, el principal factor de deforestación es la minería ilegal. En consecuencia, dicha actividad triplico la deforestación en las últimas décadas y trajo problemas de trata de personas y demás actos de violencia a la zona.

El 26 de setiembre del 2016, la Policía Nacional destruyó implementos usados para la minería ilegal, valorizados en cuatro millones de soles, en un operativo en la reserva de Amarakaeri, en la región Madre de Dios. Los operarios encontraron maquinarias pesadas, motores, herramientas de campamentos y a dos presuntos mineros ilegales. Asimismo, participaron la Fiscalía Especializada en Materia Ambiental de Madre de Dios la cual procedió a ordenar la destrucción de los implementos hallados.